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研究发现肠道细菌改变肠道及大脑功能

2017-08-09 江舜尧 微生太

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麦克马斯特大学的一项研究发现,肠道内的细菌对肠易激综合症(IBS)患者的肠道和行为都有影响,这一发现可能会促使新的微生物组定向疗法的产生。

于2017年3月1日发表在ScienceTranslational Medicine上的这项研究是由Premysl Bercik博士和Stephen Collins博士领导的(他们来自麦克马斯特的Farncombe家庭消化健康研究所),而且与滑铁卢大学的研究人员合作。

IBS是世界上最常见的胃肠道疾病。它影响大肠并导致患者腹部疼痛,排便习惯改变(如腹泻和便秘),还通常伴有长期焦虑或抑郁。目前针对改善该症状的治疗方法效果有限,因为根本原因尚不清楚。

这项研究的目的是探索伴有腹泻的IBS人类患者的粪便微生物组是否能够影响受体鼠的肠道和大脑功能。研究人员将来自有或没有焦虑的IBS患者的肠道微生物组移植到无菌小鼠体内。结果,与那些移植了健康个体肠道微生物组的小鼠相比,这些受体鼠的肠道功能和行为都发生了变化,与作为供体的IBS患者的趋于一致。

研究人员发现,受粪便移植影响的疾病包括胃肠传输(食物离开胃和通过肠道的时间),肠屏障功能障碍,低度炎症及焦虑。

“这是一项具有里程碑意义的研究,因为它超越了简单的关联,并证明了微生物组的变化影响了IBS患者肠道和行为反应。”Giada De Palma说,他是这项研究的第一作者。

“我们的发现为针对肠道微生物组的疗法提供了基础,并为IBS的诊断提供了生物标记。”Premysl Bercik说,他是该研究的主要作者,也是麦克马斯特大学的医学副教授。

作者们总结说,他们的发现增加了一种可能性,即“微生物组指导的治疗(包括益生元或益生菌治疗),可能不仅有利于治疗肠道症状,也有利于IBS的行为表现。”

作者指出,该研究表明肠道微生物组可以影响大脑,这增加了表明“肠道微生物组在一系列脑部疾病中起到一定的作用”的证据,这些疾病包括焦虑其其它疾病,例如自闭症、帕金森和多发性硬化症。然而,他们补充说,需要进一步的工作来更好地研究这些条件下的关系。


参考文献:Transplantation offecal microbiota from patients with irritable bowel syndrome alters gutfunction and behavior in recipient mice," Science Translational Medicine



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5. 分析内容

分析项目

分析

备注

基础分析项目

原始测序数据的质控



1

原始测序数据的处理


2

疑问序列的剔除


3

高质量序列长度分布统计


序列归并和OTU划分

1

OTU划分


2

OTU分类地位鉴定


3

OTU精简和分类鉴定结果统计


4

多样本共有OTU的Venn图分析

样本(组)≤ 5


常规分析项目

Alpha多样性分析

1

Rarefaction稀疏曲线


2

Specaccum物种累积曲线

样本≥ 10

3

丰度等级曲线


4

Alpha多样性指数计算


分类组成分析

1

各分类水平的微生物类群数统计


2

各分类水平的分类学组成分析


3

Metastats分析

样本(组)≥ 2

4

LEfSe分析

分组≥ 2

群落组成交互式可视化

1

系统发育树构建


2

MEGAN可视化展示


3

GraPhlAn可视化展示


4

Krona交互式展示


5

热图分析

样本≥ 3

Beta多样性分析

1

PCA分析

样本≥ 3

2

UniFrac-PCoA分析

样本≥ 3

3

UniFrac-MDS分析

样本≥ 5

4

UniFrac-UPGMA聚类分析

样本≥ 3

5

基于UniFrac距离的多组比较和箱线图展示

分组≥ 2

高级分析项目

菌群比较分析和关键物种筛选

1

RDA分析

样本≥ 3:提供影响因素数值或分组≥ 2

2

PLS-DA分析

分组≥ 2

3

Adonis/PERMANOVA分析

样本≥ 3:提供影响因素数值或分组≥ 2

4

ANOSIM分析

分组≥ 2

5

随机森林分析

分组≥ 2

优势物种互作关联网络分析

样本(组)≥ 3

群落代谢功能预测

仅限16S rRNA基因数据

 


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