研究发现肠道细菌改变肠道及大脑功能
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麦克马斯特大学的一项研究发现,肠道内的细菌对肠易激综合症(IBS)患者的肠道和行为都有影响,这一发现可能会促使新的微生物组定向疗法的产生。
于2017年3月1日发表在ScienceTranslational Medicine上的这项研究是由Premysl Bercik博士和Stephen Collins博士领导的(他们来自麦克马斯特的Farncombe家庭消化健康研究所),而且与滑铁卢大学的研究人员合作。
IBS是世界上最常见的胃肠道疾病。它影响大肠并导致患者腹部疼痛,排便习惯改变(如腹泻和便秘),还通常伴有长期焦虑或抑郁。目前针对改善该症状的治疗方法效果有限,因为根本原因尚不清楚。
这项研究的目的是探索伴有腹泻的IBS人类患者的粪便微生物组是否能够影响受体鼠的肠道和大脑功能。研究人员将来自有或没有焦虑的IBS患者的肠道微生物组移植到无菌小鼠体内。结果,与那些移植了健康个体肠道微生物组的小鼠相比,这些受体鼠的肠道功能和行为都发生了变化,与作为供体的IBS患者的趋于一致。
研究人员发现,受粪便移植影响的疾病包括胃肠传输(食物离开胃和通过肠道的时间),肠屏障功能障碍,低度炎症及焦虑。
“这是一项具有里程碑意义的研究,因为它超越了简单的关联,并证明了微生物组的变化影响了IBS患者肠道和行为反应。”Giada De Palma说,他是这项研究的第一作者。
“我们的发现为针对肠道微生物组的疗法提供了基础,并为IBS的诊断提供了生物标记。”Premysl Bercik说,他是该研究的主要作者,也是麦克马斯特大学的医学副教授。
作者们总结说,他们的发现增加了一种可能性,即“微生物组指导的治疗(包括益生元或益生菌治疗),可能不仅有利于治疗肠道症状,也有利于IBS的行为表现。”
作者指出,该研究表明肠道微生物组可以影响大脑,这增加了表明“肠道微生物组在一系列脑部疾病中起到一定的作用”的证据,这些疾病包括焦虑其其它疾病,例如自闭症、帕金森和多发性硬化症。然而,他们补充说,需要进一步的工作来更好地研究这些条件下的关系。
参考文献:Transplantation offecal microbiota from patients with irritable bowel syndrome alters gutfunction and behavior in recipient mice," Science Translational Medicine
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1 | 原始测序数据的处理 | √ | |
2 | 疑问序列的剔除 | √ | |
3 | 高质量序列长度分布统计 | √ | |
序列归并和OTU划分 | |||
1 | OTU划分 | √ | |
2 | OTU分类地位鉴定 | √ | |
3 | OTU精简和分类鉴定结果统计 | √ | |
4 | 多样本共有OTU的Venn图分析 | √ | 样本(组)≤ 5 |
常规分析项目 | |||
Alpha多样性分析 | |||
1 | Rarefaction稀疏曲线 | √ | |
2 | Specaccum物种累积曲线 | √ | 样本≥ 10 |
3 | 丰度等级曲线 | √ | |
4 | Alpha多样性指数计算 | √ | |
分类组成分析 | |||
1 | 各分类水平的微生物类群数统计 | √ | |
2 | 各分类水平的分类学组成分析 | √ | |
3 | Metastats分析 | √ | 样本(组)≥ 2 |
4 | LEfSe分析 | √ | 分组≥ 2 |
群落组成交互式可视化 | |||
1 | 系统发育树构建 | √ | |
2 | MEGAN可视化展示 | √ | |
3 | GraPhlAn可视化展示 | √ | |
4 | Krona交互式展示 | √ | |
5 | 热图分析 | √ | 样本≥ 3 |
Beta多样性分析 | |||
1 | PCA分析 | √ | 样本≥ 3 |
2 | UniFrac-PCoA分析 | √ | 样本≥ 3 |
3 | UniFrac-MDS分析 | √ | 样本≥ 5 |
4 | UniFrac-UPGMA聚类分析 | √ | 样本≥ 3 |
5 | 基于UniFrac距离的多组比较和箱线图展示 | √ | 分组≥ 2 |
高级分析项目 | |||
菌群比较分析和关键物种筛选 | |||
1 | RDA分析 | √ | 样本≥ 3:提供影响因素数值或分组≥ 2 |
2 | PLS-DA分析 | √ | 分组≥ 2 |
3 | Adonis/PERMANOVA分析 | √ | 样本≥ 3:提供影响因素数值或分组≥ 2 |
4 | ANOSIM分析 | √ | 分组≥ 2 |
5 | 随机森林分析 | √ | 分组≥ 2 |
优势物种互作关联网络分析 | √ | 样本(组)≥ 3 | |
群落代谢功能预测 | √ | 仅限16S rRNA基因数据 |
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